Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DAP3P51398 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DAP3P51398 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DAP3P51398 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DAP3P51398 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms