Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRA4P48169 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms