Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRA2P47869 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRA2P47869 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms