Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL35P42766 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL35P42766 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms