Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ITGAEP38570 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAEP38570 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms