Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZEB1P37275 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms