Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
POLR2IP36954 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLR2IP36954 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms