Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA7P36544 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms