Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXD12P35452 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms