Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SFTPDP35247 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms