Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GPC1P35052 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPC1P35052 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPC1P35052 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GPC1P35052 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GPC1P35052 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GPC1P35052 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GPC1P35052 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms