Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5AP29375 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5AP29375 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KDM5AP29375 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5AP29375 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms