Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCAP28676 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCAP28676 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCAP28676 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCAP28676 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCAP28676 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCAP28676 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCAP28676 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCAP28676 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms