Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK11BP21127 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK11BP21127 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms