Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPN2P17655 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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