Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GCFC2P16383 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCFC2P16383 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms