Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MUC1P15941 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MUC1P15941 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MUC1P15941 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MUC1P15941 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MUC1P15941 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms