Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXD8P13378 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXD8P13378 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms