Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PGA3P0DJD8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PGA3P0DJD8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms