Protein–RNA interactions for Protein: P01571

IFNA17, Interferon alpha-17, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA17P01571 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IFNA17P01571 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms