Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOMM40O96008 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TOMM40O96008 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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