Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DDX58O95786 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX58O95786 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX58O95786 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX58O95786 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX58O95786 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DDX58O95786 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DDX58O95786 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DDX58O95786 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DDX58O95786 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms