Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GABARAPO95166 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GABARAPO95166 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms