Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDKL5O76039 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDKL5O76039 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms