Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PITX3O75364 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PITX3O75364 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms