Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTNND1O60716 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNND1O60716 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms