Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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PDE6DO43924 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDE6DO43924 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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