Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXA2O43364 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXA2O43364 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms