Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CTIFO43310 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTIFO43310 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms