Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ARPC1BO15143 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARPC1BO15143 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms