Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLRMTO00411 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLRMTO00411 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms