Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HIP1O00291 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HIP1O00291 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HIP1O00291 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIP1O00291 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
HIP1O00291 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms