Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
NPIPB9F8W1W9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms