Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP17L13C9JLJ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L13C9JLJ4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms