Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM1B2RUZ4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms