Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
HMGB1P1B2RPK0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms