Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HELTA6NFD8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HELTA6NFD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HELTA6NFD8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms