Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3B2A6NCE7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms