Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX9Q9Y5X1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX9Q9Y5X1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNX9Q9Y5X1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNX9Q9Y5X1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms