Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX13Q9Y5W8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX13Q9Y5W8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX13Q9Y5W8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX13Q9Y5W8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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