Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GTF3C5Q9Y5Q8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C5Q9Y5Q8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GTF3C5Q9Y5Q8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GTF3C5Q9Y5Q8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GTF3C5Q9Y5Q8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms