Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P2

CSAG2, Chondrosarcoma-associated gene 2/3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2Q9Y5P2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSAG2Q9Y5P2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSAG2Q9Y5P2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSAG2Q9Y5P2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSAG2Q9Y5P2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSAG2Q9Y5P2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSAG2Q9Y5P2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSAG2Q9Y5P2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSAG2Q9Y5P2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSAG2Q9Y5P2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSAG2Q9Y5P2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSAG2Q9Y5P2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSAG2Q9Y5P2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms