Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM9Q9Y5J7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM9Q9Y5J7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TIMM9Q9Y5J7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TIMM9Q9Y5J7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TIMM9Q9Y5J7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TIMM9Q9Y5J7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM9Q9Y5J7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TIMM9Q9Y5J7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms