Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3D2

MSRB2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB2Q9Y3D2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSRB2Q9Y3D2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSRB2Q9Y3D2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSRB2Q9Y3D2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSRB2Q9Y3D2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MSRB2Q9Y3D2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms