Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C1

NOP16, Nucleolar protein 16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP16Q9Y3C1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOP16Q9Y3C1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NOP16Q9Y3C1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NOP16Q9Y3C1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOP16Q9Y3C1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms