Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RPH3AQ9Y2J0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPH3AQ9Y2J0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPH3AQ9Y2J0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPH3AQ9Y2J0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms