Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
NINLQ9Y2I6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NINLQ9Y2I6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NINLQ9Y2I6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NINLQ9Y2I6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NINLQ9Y2I6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NINLQ9Y2I6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NINLQ9Y2I6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NINLQ9Y2I6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NINLQ9Y2I6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms