Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITM2BQ9Y287 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2BQ9Y287 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ITM2BQ9Y287 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITM2BQ9Y287 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITM2BQ9Y287 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1013.1 ms