Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERGIC3Q9Y282 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERGIC3Q9Y282 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERGIC3Q9Y282 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERGIC3Q9Y282 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERGIC3Q9Y282 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms