Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
VDAC3Q9Y277 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VDAC3Q9Y277 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VDAC3Q9Y277 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VDAC3Q9Y277 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms